1.SIBO的不良后果
结肠，因为存在一个宠大的的微生态菌群，所以它的结构已经适应了细菌的定植。而小肠不同，小肠内一旦细菌过度生长会直接或间接影响小肠组织学结构和相应的功能，从而导致众多的不良后果。首先是吸收不良，小肠细菌过度生长会通过各种途径导致吸收不良，小肠细菌过度生长导致的肠粘膜炎症和不同程度的绒毛萎缩会直接造成吸收受损。
小肠细菌过度生长能直接干扰胆盐的代谢，将结合胆盐分解成游离胆盐，游离胆盐被小肠迅速重吸收，由于结合胆盐数量减少会降低对脂肪的乳化作用，出现脂肪吸收不良进而导致腹泻。腹泻又可以导致小肠消化酶的丢失并破坏消化酶，引起消化功能障碍加重吸收不良。乳糖酶丢失可以引起继发性乳糖不耐受，当小肠内游离胆汁酸达到一定浓度时能损伤上皮细胞吸收的超微结构从而影响糖和蛋白质的吸收。碳水化合物吸收不良可能是肠道细菌对糖的腔内降解以及与细菌相关的肠细胞双糖酶和刷状缘水解酶活性降低，和单糖酶吸收受损所致。细菌产生的毒素能够抑制肠粘膜消化酶和胰腺消化酶的活性，就从另一个途径造成吸收不良。
小肠中的细菌可以吃B族维生素，例如维生素B12，当小肠细菌过度生长时，细菌可与宿主争夺维生素B12，维生素B12会被牢固的结合于菌体内不能被宿主利用，内因子虽可以抑制需氧菌对维生素B12的争夺使他们摄取维生素B12的速度减慢，但不能抑制拟杆菌对维生素B12的摄取，细菌还可以产生维生素B12的协抗物质，这几种作用综合导致维生素B12缺乏。这种缺乏不会被口服内子纠正，进而导致大细胞贫血。
由于小肠细菌过度生长的情况下会造成脂肪消化不良和吸收不良，导致脂溶性维生素缺乏，维生素K缺乏会造成皮肤粘膜出血，不过由于肠菌合成的叶酸会释放进入肠腔被我们身体利用，因此我们不会出现叶酸的缺乏。
由于肠菌消耗重要的胺基酸，在人体吸收这些胺基酸之前先消化了他们因此导致我们蛋白质缺乏和胺产生增加。长期小肠细菌过度生长者约70-90%会发生低蛋白血症。低蛋白血症可导致营养不良性水肿。
小肠细菌过度生长是造成肠漏的重要原因。肠漏就是指小肠上皮细胞遭到破坏，细胞骨架变形，细胞间紧密连变得疏漏。细菌分泌的包括内毒素在内的害代谢产物可损害小肠粘膜细胞使肠粘膜变薄，上皮细胞的绒毛纤细和变短，上皮细胞韧窝短浅表面积减少，上皮细胞再生能力减弱。这些都使小肠内有害物质进入血液循环增多引起肌体出现慢性炎症反应。近年来对肠道微生态的研究不断发现从小肠进入血液的炎性因子导致的体内慢性炎症反应与多种疾病存在高度相关性。
小肠细菌产生的内毒素与细胞膜上的胰岛素受体会起反应造成胰岛素抵抗最终引起血糖升高。内毒素还可以加速脂肪在肌肉和脂肪组织内的堆积造成肥胖。
类黄酮一种天然的抗氧化物质，小肠细菌可以破坏膳食中的类黄酮降低抗氧化能力增加癌症风险。
小肠细菌在代谢过程中会产生亚硝胺，增加癌症的风险。
小肠细菌还可以氢化多不饱和脂肪酸，使体内的反式脂肪酸水平升高。
2.SIBO的常见症状
细菌可以发酵碳水化合物产生气体，包括氢气、甲烷、二氧化碳、硫化氢。细菌产生的气体会导致腹胀、疼痛、肠运动的改变、充血和胀气。如果气体的量很大会导致严重的膨胀，肠道对压力敏感，因此膨胀的压力会导致腹痛。气体还影响肠道动动，氢气与腹泻密切相关，甲烷与便秘密切相关，甲烷产生的量与便秘的严重程度相关。当氢气和甲烷都存在时，根据这些气体量出现腹泻和便秘交替现象。小肠细菌能水解甘油脂合成脂肪再经过小肠细菌的纤化作用转化成纤化脂酸刺激肠粘膜而产生腹泻。因此，小肠细菌过度生长的常见症状就包括：产气、腹胀、腹痛、腹泻、便秘或者不规律的腹泻、便秘。体重减轻、多种食物慢性过敏、维生素和矿物质的缺乏、贫血。贫血往往由于维生素B12缺乏引起，属于大细胞贫血。长期消化和吸收不良，以及慢性腹泻等综合性因素会造成身体缺乏营养物质导致体重的下降。
3.SIBO导致胃食管反流
临床很多人会服用质子泵抑制剂来抑制胃酸的分泌，胃酸不足会使上消化道细菌定植，小肠细菌过度生长。另外胃酸不足会造成碳水化合物消化不良，使得细菌产气增多导致腹内压增加而发生胃食管反流。
SIBO引起或加重肝脏疾病
小肠细菌分泌的包括脂多糖内毒素在内的肠源性毒素通过门静脉系统进入肝脏激活肝内细胞括弧式细胞，造成肝脏发生炎性病变。发生脂肪肝和肝硬化。肝脏病变反过来又可以加重小肠细菌过度生长。小肠细菌分泌的毒素与胰腺反应会引起慢性胰腺炎，并导致胰岛细胞的炎性反应造成胰岛缺乏的糖尿病的发生。
4.大脑-胃肠-皮肤轴
当前，小肠细菌过度生长的一个研究领域，就是大脑-胃肠-皮肤轴。研究已经提出了抑郁、焦虑和痤疮重叠的胃肠机制，发现情绪状态可以改变肠道菌群，增加肠道通透性并导致全身炎症状态，就包括皮肤的病变。
5.SIBO的前置因素、诱发因素及介质因素
肠道菌群失调、念珠菌增殖、寄生虫感染
幽门螺杆菌感染
消化酶产生不良
压力
免疫力低下
隐形感染
慢性疾病
酸阻滞剂的使用
抗生素使用过多
饮食中碳水化合物、糖、果糖太多
酒精
口服避孕药
以上这些都是诱发小肠细菌过度生长的因素，值得一提的是酒精可以影响消化道的每一个部分，当它经过口腔和咽喉时会引起局部的刺激，在胃里它也会对胃产生刺激和炎症反应进而导致溃疡的发生，长期饮酒会造成正常肠道菌群的功能异常和营养不良，营养不良可进一步改变肠道菌群的不平衡状态造成肠道菌群失调。饮酒可增加肠道中的醋酸水平，醋酸水平的增加反过来会抑制糖的代谢进一步损害肠道功能。酒精会损伤肠道粘膜细胞使肠道通透性增大发生肠漏，能够减少肌肉收缩和蠕动导致出现肠道动力问题，长期饮酒会引起胰腺炎和肝脏的炎症，此外酒精促使一些特定类型的肠道细菌过度生长，细菌产生的毒素释放到血液中会导致焦虑、抑郁等神经行为改变以及对酒精的渴求。
6.可以帮助确诊的病史线索
腹胀往往出现在餐后，且摄入纤维后会加重症状
使用抗生素治疗后，临床消化道症状会得到缓解
禁食或断食后，临床消化道症状会得到缓解
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